城东清真寺位于肇庆市端州区水师营路17号，始建于明末清初，已有300余年历史，是肇庆市伊斯兰教文化的宝贵历史遗产和伊斯兰教重要活动场所，1984年被列为市重点文物保护单位。寺内现保存古碑匾11件，古文书籍一批。

1946年，寺内开设经堂，次年经堂改办为私立清真小学。新中国成立后，成为公办清真小学。1966年后改名为肇庆市（现端州区）第十七小学，保留大殿，其他建筑改建为教学楼。1991年，落实宗教政策，将寺大殿以北的土地划给第十七小学使用，寺大殿以南土地归清真寺，并补偿人民币45万元，重修大殿对外恢复开放。2004—2006年得到肇庆市、端州区人民政府拨款资助；省港澳及海外等地穆斯林团体、各方哈志众乡老鼎力支持，慷慨捐资，重修阿訇住房、经堂、办公室、会议室、沐浴室、卫生间等配套设施。

恢复开放以来，该寺坚持“和平、中道、团结、宽容”的和谐理念和优良传统，认真贯彻党的民族、宗教政策，力促民族团结、宗教和睦；加强管理，重视自身建设，热心公益、服务社会，近年向社会公益事业捐资近80万元。2008年被评为“广东省模范宗教活动场所”。2010年9月底，该寺被广东省委宣传部、广东省委统战部、广东省民族宗教委评为首批“广东省民族团结教育基地”